Thordur Gudjonsson (14 oktober 1973), was een IJslandse voetballer die zijn loopbaan in 2008 beëindigde bij de IJslandse eersteklasser IA Akranes. Eerder speelde hij onder andere voor VfL Bochum, KRC Genk, UD Las Palmas en Derby County.
Met IA Akranes werd Þórður Guðjónsson (onvervalst IJsland’s) in 1992 en 1993 landskampioen. Met KRC Genk werd hij Belgisch landskampioen in 1999, speelde hij om de Beker van België en won deze ook in 1998 en 2000. Ook speelde hij om de Supercup in 1998, 1999 en 2000, helaas zonder succes.
Thordur Gudjonsson was wat de Duitsers ein Profi noemen: een profvoetballer in de ware zin van het woord. Hij leefde voor zijn vak, bijna maniakaal bezig met de verzorging van zijn lichaam én handelend altijd in het belang van het team. Als hij de kans kreeg om iedereen wakker te schudden, liet hij dat zeker niet onbenut. In 348 wedstrijden wist hij het goede voorbeeld te geven door 85 maal te scoren.
Middenvelder Guðjónsson speelde in de periode 1993-2004 58 interlands voor de IJslandse nationale ploeg, waarin hij dertien goals kon scoren. Hij maakte zijn debuut op 8 september 1993 in de WK-kwalificatiewedstrijd tegen Luxemburg.
Gudjonsson heeft twee broers die ook op professioneel niveau voetbal spelen: Joey en Bjárni. In 2009 kwam Gudjonsson in het nieuws omdat hij het IJslandse parlement in wilde als kandidaat voor de Onafhankelijke Partij. Dit is echter nooit gelukt.